Siim Kelner on tegutsenud treenerina alates 2012. aastast ning omab Eesti Olümpiakomitee 7. taseme treenerikutset. Igapäevaselt töötab ta Sparta Spordiklubis, kus viib läbi noorte jõusaalitreeninguid, personaaltreeninguid ning haldab jõusaali tegevusi. Praegu töötab Siim õppejõuna Tallinna Ülikooli Loodus- ja Terviseteaduste Instituudis, kus ta õpetab aineid „Üldkehalise ettevalmistuse didaktika“ ning „Liikumisharrastuse teooria ja metoodika“. Lisaks õpetab ta ka funktsionaalse treeningu mikrokraadi raames. Varasemalt on ta olnud samas instituudis ka nooremteadur. Õppejõuna on ta juhendanud üle 20 üliõpilase lõputöö. Siim on koostanud treenerite tasemeõppekavasid Eesti Kulturismi ja Fitnessi Liidu ning Jõutõsteliidu jaoks ning viinud läbi taseme- ja täiendkoolitusi ka Kergejõustiku Liidus, Jalgpalli Liidus ja Tõstespordi Liidus. Samuti koolitab ta liikumisharrastuse treenereid ning on teinud koolitusi Eesti Toitumisnõustajate ja Terapeutide Ühenduses, ühenduses Sport Kõigile ning erinevates ettevõtetes. Lisaks viib Siim läbi mentorlust alustavatele treeneritele, pakkudes neile tuge ja juhendamist erialase arengu teekonnal. Varasemalt on ta tegutsenud rahvusvahelise rühmatreeningute ettevõtte Les Mills Nordic AB koolitaja ja meistertreenerina. Koolitajana usub Siim, et iga inimene peaks omama piisavalt teadmisi liikumisest ja toitumisest, et oma tervise eest teadlikult ja tõhusalt hoolt kanda.