Siim Kelner on töötanud treenerina alates 2012. aastast ning omab EOK treeneri 7. kutsetaset. Alates 2020. aastast on ta töötanud Tallinna Ülikooli Loodus- ja Terviseteaduste Instituudis õppejõu ja nooremteadurina lugedes „Üldkehalise ettevalmistuse didaktika“ ja „Liikumisharrastuse teooria ja metoodika“ nimelisi ainekursuseid. Samuti on ta kuulunud „Funktsionaalse treeningu alused“ nimelise mikrokraadi koostajate töörühma ning on üks õppejõududest, kes antud mikrokraadi õpet ka läbi viib. Lisaks sellele on ta koostanud Kulturismi ja Fitnessi Liidu ning Jõutõsteliidu treenerite tasemeõppekavasid, viinud läbi tasemeõppe koolitusi ning täiendkoolitusi ka Kergejõustiku Liidus, Jalgpalli Liidus ja Tõstespordi Liidus. Varasemalt on ta olnud ka rahvusvahelise rühmatreeningute ettevõtte Les Mills Nordic AB koolitaja ja meistertreener. Igapäevaselt töötab ta Sparta Spordiklubis treenerina viies läbi noorte jõusaalitreeninguid, personaaltreeninguid ning haldab jõusaalis toimuvaid tegevusi. Koolitajana usub ta, et iga inimene võiks omada piisavalt teadmisi toitumisest ja liikumisest, et oma tervise eest võimalikult hästi hoolt kanda.